美国时间 6 月 2 日上午,在沃尔特华盛顿会议中心举办的美国消化疾病周(DDW2018)上,美国胃肠病学会(AGA)组织了胃肠道微生物群和微生物疾病的杰出摘要全体会议。来自美国波士顿儿童医院的 Majdi Osman,在会上分享了他们团队关于粪便菌群移植(FMT)对复发性艰难梭菌感染(CDI)治疗低效是否与供体有关的最新研究进展。
在使用粪便菌群移植(FMT)对复发性艰难梭菌感染(CDI)进行治疗的过程中,是否存在粪便供体效应?
虽然 FMT 对复发性 CDI 的治疗有效,然而在两项关于 FMT 治疗溃疡性结肠炎的临床试验中,发现了粪便供体效应,但没有证据显示供体特征决定 CDI 的临床治愈。粪便库通过标准的捐赠者选择和严格的质量控制,对大量的捐赠者和站点监测,发现疗效上的明显差异。通过分析患者和捐赠者的微生物群落特征,以评估造成明显供体效应的原因。
排除干扰因素,不同供体之间的粪便菌群移植效率并没有明显差异
2014 年 1 月 16 日-2016 年 4 月 12 日期间,研究团队收集了美国 50 个州和其他 8 个国家 945 家医疗机构的患者信息,包括 CDI 的类型(复发性、难治性)、FMT 操作方式、保健师和医生记录的临床结果等。患者的数据与粪便捐赠者相关联。
通过 16S rRNA 测序确定供者的粪便微生物分布。通过 QIIME 构建标准操作分类单元(OUT)和分类表(97% OTU)。用 Phyloseq 法测定了α-多样性 (Shannon 指数)、β-多样性 (Jensen-Shannon 多样性,JSD) 和分类异常相对丰度。对复发性 CDI 和与供体疗效的相关的因素进行回归分析。
51 个供体治疗了 2050 例复发性 CDI 患者。供体平均年龄 28 岁(19-45),40/51(78%)为男性患者,平均体重指数(BMI)为 22.75 kg/m2。其中一个供体(供体 X)相比其他供体,表现出较低的临床治愈率 (70.5%, 61/86, P<0.05),其他供体整体平均临界治愈率(88.4%)。
通过 16s RNA 测序评估了供体 X 和其他 19 个健康供体的微生物菌群,供体 X 和其他捐赠者的α-多样性没有差异(图 1a);
(图 1a)
与其他随机选择的 4 个供体相比,供体 X 的平均 JSD 最低(图 1b);
(图 1b)
开始阶段,供体 X 的微生物组成和其他所有供体相似(图 2)。
(图 2)
为了评估受体和环境的因素,通过校正医疗设施、操作方式和疾病类型后,回归分析显示供体 X 和其他供体的粪便菌群移植效率没有明显差异(P = 0.08)。
供体因素并不会影响复发性 CDI 患者的临床治愈率
这是首次在真实患者中进行的通过对供体微生物组测序分析粪便菌群移植低效率的回顾性研究。此次研究结果证实,供体因素不会影响复发性 CDI 患者的临床治愈率。与供体因素相比,受体因素和临床经验,包括合适的 CDI 病例,可能会影响 FMT 的结果。