一、达尔文和他的进化论
一八零九年，达尔文（Charles Robert Darwin）出生于英格兰的苏兹伯利（Shrewsbury）。他父亲是一位成功的医生。他五岁丧母，十六岁进入爱丁堡大学学医，他父亲希望达尔文能继承祖业行医。
然而，两年的学习和两次见习无麻醉的手术后，达尔文开始头痛、心悸、反胃、呕吐和腹泻。于是他转入剑桥的基督学院念神学预科，二十二岁时通过了文学士的考试，他选择了到乡间的英国圣公会教堂，预备在那里成为一名牧师。
达尔文生长在一个不信神的家庭。他的祖父（Erasmus Darwin，1731-1802）是一位著名医生，是第一位使用“进化”（Evolution）一词的人。达尔文的父亲（Robert Darwin）的不信比他祖父更甚。
在爱丁堡的两年中，达尔文结识了几位地质学家、动物学家和植物学家，一起讨论法国生物学家拉马克所倡导的渐进式的进化学说。后来他从事探险、生物考察，到了一八五九年，达尔文出版了他最著名的著作《物种起源》（The Origin of Species by Means of Natural Selection：or the Preservation of Favored Races in the Struggle for Life.），这是整个人类历史上一个里程碑，甚至达尔文也不曾想象得到这一本书对人类所产生的影响有何等的深远，它不仅影响了生物学的发展，更重要的是它影响了人类社会的各个层面，科学、社会、宗教、文化、教育、法律……。达尔文卒于一八八二年，葬于威斯敏斯特教堂（Westminster Abbey）。他的墓被安放于大科学家牛顿的墓旁。
在《物种起源》这本书里，达尔文主要记述了他在Galapagos群岛的观察研究。该群岛位于赤道附近的太平洋上，属于南美洲的厄瓜多尔。一八三五年，达尔文随猎犬号（HMS Beagle）船，第一次来到这里。猎犬号船的本来目的是发现和测验海岸地图，并寻找有商业价值的矿物。但几年的考察使热爱自然的达尔文有幸看到未遭破坏的自然界：原始热带雨林，各种地层，火山，各种风俗的民族，各种各样的昆虫、鸟类和哺乳动物，每种生物与它们所处的环境完美地契合。特别是达尔文观察到一些鸟类（Darwin‘s finches）的生物性状随环境改变而改变，比如鸟嘴的形状受食物的影响
达尔文观察到的生物学现象主要有两类，即Galapagos群岛鸟类受环境影响 生的变异，以及人工育种的现象。根据这些现象，达尔文提出生物进化的学说，叫做渐进（Gradualism），也就是通常所说的自然进化论（Naturalistic Evolutionism），或者简单称为进化论。在这里，所谓“渐进”是指进化是一个缓慢持续的过程。所谓“自然”是指自然而然，不借助外来的能力或智慧，也就是不需要神，或者外来智慧的设计，乃是借 自然选择（Natural Selection） 。
二、进化论的演变
虽然达尔文并不是第一个提出“进化”这个概念的人，但是在他以前的进化论，只不过被人视为类似催眠术、颅相术的伪科学（Pseudoscience）。达尔文的贡献在于，他为进化的信念提供了理论基础，而且指出进化的动力在于生存竞争产生的自然选择。真正广泛推广自然进化论的人，乃是当年号称达尔文斗犬的赫胥黎（Thomas Henry Huxley），在英国哲学家斯宾塞（Herbert Spencer）的帮助下，赫胥黎以自然进化论为基石，推动当时的英国社会改革。
二十世纪三十年代，自然选择和孟德尔（Gregor Mendel）的遗传学结合在一起，再加上Hugo DeVries的突变概念，使得达尔文的自然进化论趋于完善，称为新达尔文主义（Neo-Darwinism）。Ronald Fisher、J.B.S. Haldane、Sewall Wright等人引入数学定量概念和概率问题，产生了合成说（Synthetic view）和漂移平衡说（Shifting Balance view）。为了解释族群内的某些合作和无私行为，William Hamilton提出族群选择说（Kin Selection View）。物种形成说（Speciation View）则用来解释族群隔绝如何 生新的物种；中立说（Neutralist View）说明突变是中立的，其结果取决于机遇；间断平衡说（Punctuated equilibrium view）解释化石的突发变化和突变速度；种系发生学说（Phylogenetic view）解释动植物各种系的发生历史。总之，这些新的学说相继发展出来，修饰并补充了自然进化论。许多人致力于研究自然进化的过程，发展出一个专门的学科-进化生物学（Evolutionary biology）。
三、支持进化论的若干证据
与此同时，不断有一些新的实验证据来支持自然进化论。比如：
1. 细菌对抗生素的耐药性和昆虫对杀虫药的抗药性。
2. 鸟的体格和在暴风中的生存能力：一八九八年美国马塞诸塞州发生一场大暴风，有人收集受伤的鸟，发现受伤的鸟多半体格较为弱小，而体格比较强壮的鸟较少受伤。
3. 食物结构的改变和鸟类的生存能力及嘴部形状的变化：一九七七年Galapagos群岛发生干旱，原来鸟类喜食的一种小种子减少，这些鸟类不得不改吃一种大种子，其结果是，许多鸟类死亡，而生存下来的鸟类嘴部较大。
4. 非洲镰状细胞性贫血的等位基因和抗疟疾的特性：非洲流行镰状细胞性贫血和疟疾，镰状细胞性贫血的等位基因和抗疟疾的等位基因相关。因为镰状细胞性贫血是一种隐性遗传疾病，所以携带两个镰状细胞性贫血等位基因的人，可以抵抗疟疾的感染，但是患镰状细胞性贫血；没有镰状细胞性贫血等位基因的人，容易患疟疾，但是不患镰状细胞性贫血；携带一个镰状细胞性贫血等位基因的人，可以抵抗疟疾的感染，又不患镰状细胞性贫血，所以这些人具有生存上的优势。非洲人对抗疟疾的基因就借 镰状细胞性贫血得以保留下来。
5. 小鼠群体会自然 生雄性不育基因，在短期内泛滥，造成全体死亡。
6. 飞蛾工业黑化现象：飞蛾的工业黑化现象是指工业污染如何影响一种飞蛾的颜色。
7. 近年来，由于基因和分子生物学研究的进步，分子进化发展成为一个重要的生物学分支。
四、进化论者的结论
简单来说，今天的进化论认为，大约一百到二百亿年前，宇宙形成。宇宙中存在 自生自长的律，使一切可以由简到繁、由低级到高级不断地进化、发展；这种进化、发展至今仍持续不断。
大约四十五亿年前，地球形成。在假想的原始宇宙环境里，地球上布满火山、雷电、宇宙射线等等。一些基本的分子、原子，渐渐变化，从简单到复杂，由无机物变成有机物，由有机物演化出蛋白质、核酸、脂类物质等等，最终产生生命
后来，单细胞生物逐渐进化到多细胞生物，生物又从低级到高级，依此从鱼类、到两栖类、到爬虫类、到哺乳类、到猿猴类，最后进化到人类。在这一过程中，生物体不断发生变异（或者突变），那些在生存竞争中具有优势的突变体，就被自然界选择出来，经过漫长的岁月，反复的突变、选择，终于产生了人 。
