肠易激综合征(lBS)是一种以腹痛或腹部不适伴排便习惯改变为特征的功能性肠病，经检查排除可引起这些症状的器质性疾病。IBS潜在的病理生理机制至今尚未完全清楚，但胃肠道动力异常、内脏感觉过敏、脑——肠轴功能改变、轻度炎性反应、精神社会因素等对肠道菌群可能起了一定的作用。
研究表明肠道菌群紊乱参与IBS的病理生理过程，IBS患者的肠道菌群中存在厚壁菌对拟杆菌的比例(firmicutes to bacteroidetes ratio,FBR)增加，菌群多样性减少，黏膜相关菌群数量增多和组成成分改变等诸多变化。因此，肠道微生态干预成为治疗包括IBS在内的多种功能性胃肠疾病的新方法。
1 肠道菌群
1.1 肠道菌群的建立
哺乳类动物宿主与微生物之间的相互作用，通过促进共生菌的定植和抵抗致病菌的黏附，刺激肠屏障功能的成熟。人体肠道菌群是一个动态变化的过程，新生儿出生时是无菌的，早期定植在肠道的微生物是高度不稳定的，主要是需氧菌，个体之间差异很大。
随着肠黏膜免疫功能的发展成熟及肠道微环境、肠道菌群本身的变化，成人肠道菌群中的优势菌群逐渐替代早期定植菌，使得整个菌群变得更复杂、更稳定，处于一种共生模式。
早期定植菌诱导肠上皮细胞岩藻糖转移酶2(FUT2)的表达，活化肠免疫系统，因此平衡稳定的肠道菌群对宿主健康具有十分重要的作用。有研究报道人体肠道优势菌群存在宿主特异性，可以分为3种肠型（拟杆菌肠型、普雷沃菌肠型、瘤胃球菌肠型），其不以性别、年龄及身体质量指数( BMI)而改变 。
1.2 肠道菌群与人类健康的关系
人类肠道细菌数量是人体自身细胞数量的10倍，其基因数量是人体的100倍，生理状态下，肠道微生物的组成、功能与宿主之间存在动态平衡，即肠道稳态。数目庞大、种类多样的微生物组成复杂的微生态系统，显著调节消化道免疫、营养物质吸收、能量代谢和肠道生物屏障功能。
正常的肠道菌群对免疫系统有很大影响。有研究发现肠相关淋巴组织和肠绒毛毛细血管在无菌动物是发育不良的，拟杆菌属类产生的多糖类物质有助于维持Thl细胞和Th2细胞的动态平衡，而B细胞的正常发育也需要共生菌的参与。肠道菌群紊乱在肥胖症、糖尿病、结直肠癌、炎症性肠病(IBD)、及IBS等多种疾病的发病机制中起着重要的作用。
2 研究菌群的方法
研究菌群的方法基本上可以分为两大类：培养性方法和培养非依赖性分子技术方法。采用培养为基础的方法研究发现肠道微生物由高度复杂的群落组成，虽然这种方法在鉴别功能群组和选择计数（例如致病菌）方面是有价值的，但80%以上的细菌是无法培养的。
培养非依赖性的分子技术方法，基于分析微生物的16SrRNA基因序列，16SrRNA是原核细胞核糖体构成的基本原件，其不但含有高度保守的序列区域，还有中度保守和高度变化的序列区域，因此适用于微生物种系发育学的研究，而且它的分子量大小适中，约1 540 bp，便于测序分析。
基于16SrRNA基因分析的指纹分析方法（如变性梯度凝胶电泳）和定位方法（如荧光原位杂交、实时定量PCR等），提供了更强大、更方便的用于监测胃肠道微生物群落变化的方法。新的高通量测序方法和激光扫描显微镜的应用，进一步有助于对胃肠道微生物的了解。
2.1 高通量测序技术及其与组学间的联系
高通量测序技术，又称深度测序，通过扩增16SrRNA基因，对DNA或互补DNA( cDNA)进行直接测序，省去了克隆的步骤，增加了测序产量，进一步扩大了肠道微生物的多样化信息，为分析肠道微生物组学提供了新的可能性。目前常用的测序平台主要有Roche/454FLX焦磷酸测序、Illumina Solexa合成测序及ABI SOLID连接法测序。
从肠道或粪便中提取全部微生物的DNA，并构建宏基因组文库，利用基因组学的研究策略研究样品所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能，称为宏基因组学。运用高通量测序或芯片分析方法检测胃肠道样本的RNA表达，可以直接反映实时环境表达信息，称为宏转录组学，具有重要的生物学意义。
采用蛋白质分离和测序技术来描述存在于肠道或粪便中的主要蛋白质，称为宏蛋白质组学，可以提供实时环境功能信息。代谢组学，其不是直接与微生物的遗传信息相联系，而是通过检测肠道微生物产物的代谢谱，提供代谢产物的总体信息。
2.2 激光扫描显微镜的应用
激光扫描显微镜( LSM)可以提供细菌在离体状态下的肠黏膜高分辨率图像，其原理是根据已知微生物的种群特异性DNA序列，通过特定分子的荧光标记探针，在细胞内与特定的核苷酸序列原位杂交，通过激发杂交探针的荧光来检测信号，检测该微生物的存在与丰度。
通过16SrRNA基因测序技术方法发现，肠腔内菌群组成与黏膜菌群组成存在显著差异；此外，非致病菌黏附在上皮细胞表面，发挥生物屏障功能，增加宿主对致病菌的抵抗能力。Parkes等发现IBS患者黏膜菌群中拟杆菌和梭状芽胞杆菌数量增加，而双歧杆菌减少。
Kerckhoffs等研究发现，IBS患者粪便样本和十二指肠黏膜样本中双歧杆菌数量显著减少，约为正常人的一半，而其他菌群无显著变化。
3 lBS中肠道菌群变化的相关研究
3.1 抗生素与IBS
肠道菌群紊乱参与IBS的发病过程，而抗生素可以改变肠道菌群，随着小肠细菌过度生长( SIBO)在IBS中的作用日益受到肯定，一种新的方法即利用抗生素治疗IBS也逐渐引起重视。研究发现非吸收性广谱抗生素利福昔明不仅可以改善IBS的症状，也可以根除SIBO，但再次治疗的有效性及耐受性需要更大样本的临床试验来验证。
Villarreal等研究发现，广谱抗生素的使用（尤其是大环内酯类和四环素类抗生素）可增加IBS的发病率。抗生素的应用与感染后IBS( PI-IBS)的风险增加也有关系。这表明抗生素在IBS应用的合理性及安全性，有待进一步研究。
3.2 炎性反应与IBS
Meta分析发现，患细菌性胃肠炎（主要是志贺氏菌、空腔弯曲菌和沙门氏菌）后1年内有相当高的风险发生IBS(RR=6.5，95%CI：2.6～15.4)，而36个月后此效应依然明显(RR=3.9，95%CI:3.0～5.0)。而病毒性胃肠炎与细菌性胃肠炎相比，却可以降低PI-IBS的发生率。
传统的培养研究方法显示，PI-IBS患者肠道内厌氧菌（如拟杆菌属和真杆菌属）含量下降10倍，而需氧菌的变化不大，表明在急性感染阶段正常厌氧菌/需氧菌比例逆转。目前运用培养非依赖性研究方法倾向于证实这些发现。有研究发现厌氧菌是结肠保留未吸收碳水化合物的关键菌群，它们可能通过阻止食物发酵为短链脂肪酸从而对腹泻型IBS患者有利。
3.3 肠道菌群——宿主相互作用
肠道菌群与宿主在维持正常黏膜的免疫功能、上皮屏障完整性、肠道运动与营养物质吸收等方面存在相互作用。研究发现大部分IBS患者中黏膜的固有和适应性免疫反应有低度活化，黏膜免疫活化对IBS患者的感觉运动功能有潜在的影响。
Barbara等发现IBS患者黏膜活检标本中释放的组胺和类胰蛋白酶引起了肠系膜感觉传人通路的活化，将这些炎性介质应用到受体鼠时，可诱导内脏高敏感的产生。肠道菌群可能是刺激免疫系统的积极参与者，也可能是由于肠上皮通透性增加使免疫系统暴露于异常的微生物抗原负载。
Turco等分别用侵袭性大肠杆菌和乳酸菌刺激肠胶质细胞( ECG)，发现ECG上表达不同的Toll样受体( TLR)，可以特异性识别致病菌和有益菌。总之，肠道菌群与宿主之间的相互作用可能是通过微生物的组成成分，其可穿过黏液黏附在上皮细胞上，诱导活化黏膜固有免疫反应。
心理因素在IBS中发挥重要作用，动物实验研究发现某种类型的心理应激可诱导肠道菌群组成变化，并伴有全身性细胞因子反应和肠道通透性增加。
4 益生菌
4.1 益生菌的应用
益生菌是可以包装成多种剂型的含一种或多种细菌的微生物制剂，有广泛的生物活性，当给机体一个合适的剂量时，可以改善宿主的微生态平衡，发挥有益的作用，最常用的是乳酸杆菌和双歧杆菌。Rousseaux等研究发现，口服乳杆菌属类益生菌制剂可诱导上皮细胞表达阿片样和大麻素受体，表明肠道微生物可以影响痛觉感知，在IBS患者内脏高敏感相关的腹痛中起作用。
Zeng等研究发现，短期应用乳酸杆菌治疗可调节腹泻型IBS患者的小肠黏膜屏障功能，改善患者的腹痛和腹胀症状，并可降低患者的IBS总体症状评分。O'Mahony等研究发现，IBS患者服用婴儿双歧杆菌35624(1×10∞CFU) 10周后，不仅改善了IBS的症状，也纠正了患者的细胞因子水平。
这表明益生菌可能在IBS的一些假定的病理生理机制方面有效应，如内脏高敏感、胃肠道动力障碍、肠道通透性增加、肠道菌群紊乱和免疫功能等方面，不同微生物制剂对这些效应的影响可能明显不同。
4.2 益生菌在肠道的定植
早期研究发现，经植物乳杆菌治疗4周的IBS患者中，84%的患者粪便培养检出摄入的益生菌，而只有32%的肠黏膜活检培养阳性，安慰剂组粪便和黏膜活检培养则全部为阴性。
有研究发现，经婴儿双歧杆菌35624治疗8周的IBS患者，其粪便中检出摄入的益生菌量在4周到8周内较安慰剂组明显升高，并达稳定水平；治疗结束后2周，粪便检出的益生菌量虽仍较安慰剂组高，但呈现下降趋势；IBS患者经益生菌治疗8周后，除梭状芽胞杆菌较安慰剂组明显升高外，其余细菌种类数量变化的差异无统计学意义。
这表明益生菌在改善IBS症状的同时，其在肠道的代谢过程及其他菌群组成变化情况，还需进一步研究。
4.3 罗马委员会对于益生菌调节IBS患者肠道菌群的临床指导
大量研究报道益生菌的应用可改善IBS的症状，但Ligaarden等研究发现，服用植物乳杆菌MF1298后却加重了IBS的症状。目前仍不清楚哪些患者受益于哪种类型的益生菌，因此罗马委员会提出如下问题：
单种益生菌制剂与多种益生菌的混合制剂孰优孰劣？
哪种益生菌药物剂型最合适（液体或胶囊）?益生菌的生存能力和生物利用度如何得到保证？
最佳的给药方案和疗程是什么？益生菌在宿主定植的频率是多少？
益生菌并非强有力的药物制剂，应针对哪种类型的患者？
是否某些患者对益生菌是禁忌的（如新生儿、免疫功能低下者或重病患者）?
是否应该针对IBS的特殊亚型给予不同的益生菌制剂？
IBS的哪些症状是治疗的主要目标？
症状改善的可能机制是什么？
5 结语
肠道菌群组成、结构及比例与健康息息相关，IBS患者存在肠道菌群失调。肠道菌群在IBS中的研究为明确IBS的发病机制、病理生理及治疗提供了新的思路。研究肠道菌群技术方法的革新，进一步帮助了学者们对肠道菌群的了解。益生菌是可以调节肠道菌群紊乱的生物制剂，在治疗IBS方面日益受到重视，但这方面尚处于试验研究阶段。
关于益生菌摄人体内后能否定植及定植在何处的研究相对缺乏，特别是改善症状的具体机制方面还有待进一步研究，这对阐明益生菌治疗IBS的机制，优化益生菌的临床应用，具有深远的意义。
本文作者：周晓艳 李铭 李延青
本文出自：《国际消化病杂志》2014年8月第34卷第4期P230~232
