美国感染病协会、美国肝病研究协会与美国国际抗病毒协会在丙肝检测、管理和治疗指南更新中提出，在资源有限的情况下，应优先治疗病情严重或传染给他人风险极大的HCV患者（http://www.hcvguidelines.org/）。
随着有效但极其昂贵的HCV治疗药物的出现（例如$1000 （£600; €748）每片的sofosbuvir），美国公共和私人医疗支付方就如何为美国三四百万HCV患者支付这笔治疗费用展开讨论。
虽然指南没有特别谈到费用的问题，通过电话简要采访指南制定小组获悉，费用是他们考虑的一个方面，但他们提到这不是他们确定哪些患者应立即接受治疗，哪些患者可以等待的依据。
芝加哥大学医学中心肝病中心主任、指南制定小组共同主席Donald Jensen说：“我们不可能立即治疗全美三四百万丙肝患者，因此需确定一些优先治疗的方式。我们也清楚治疗方法和手段会随着时间不断进步，对一些可以等待的患者而言，改进后的治疗或许对他们更有好处。”
在新的指南推荐中，拥有最高优先权利获得治疗的是进展期肝纤维化、代偿期肝硬化、已接受肝移植、及有严重丙型肝炎肝外并发症的患者。最后一类患者可能的并发症有冷球蛋白血症导致的终末器官损伤，例如膜增生性肾小球肾炎或中枢神经系统脉管炎。
其次拥有优先权的是出现并发症风险大的患者，指南中提到的有合并HIV 1感染、乙型肝炎共同感染、迟发性皮肤卟啉病或胰岛素抵抗的2型糖尿病。
除此之外传染性高的患者也应优先获得治疗，例如男同性恋患者、注射吸毒患者，罪犯及长期血液透析患者。
在美国监狱，HCV血清学阳性率在30%至60%不等，一年的急性感染率约为1%。指南中提到，成功的治疗高传播风险，且仍继续高危生活方式的患者是阻止HCV传播的有利重要措施。
指南还补充道，对于可以暂缓治疗的患者，应监测其肝纤维化的进展情况，以决定治疗的急缓。
虽然理想的评估间隔尚未确定，比较合适的做法是每年进行肝纤维化评估，以指导修改危险因素及更新需要监测的肝功能项目和疾病进展标志物。对于所有进展期肝纤维化的患者，应至少每6个月进行一次肝癌的筛查。
